[general_comp] Invitación a la Defensa de Tesis de Licenciatura de Mariano Oca

[Pablo Turjanski]

Estimadas y estimados,

Tenemos el agrado de invitarlos a la defensa de Tesis de Licenciatura en
Ciencias de la Computación de Mariano Oca.

Título: Estudio de Complejidad en Secuencias de Aminoácidos de Proteínas

Cuándo: jueves 28 de agosto de 2025, a las 14:00 hs.
Dónde: Sala 1604, del Pabellón Cero+Infinito, Ciudad Universitaria

Director: Dr. Pablo Turjanski
Co-Director: Dr. Ignacio Sánchez

Jurados:
Dra. Verónica Becher
Dr. Diego Ferreiro

Resumen:
Motivados por la necesidad de explorar patrones estructurales y niveles de
aleatoriedad en secuencias biológicas, este trabajo presenta el diseño e
implementación de una herramienta para analizar la complejidad algorítmica
de secuencias de aminoácidos en proteínas. La herramienta integra diversas
medidas de complejidad: Icalc, discrepancia, discrepancia en bloque,
entropía de Shannon, entropía de segundo orden, compresión basada en gzip y
aproximaciones de Kolmogorov y Bennett.
Estas métricas se aplicaron a datos en formato FASTA de proteínas naturales
obtenidas de UniProt, así como a variantes sintéticas generadas a partir de
la modificación de dichas secuencias. Entre las variantes consideradas se
incluyeron: shuffled (reordenamiento aleatorio de aminoácidos), random
(generación aleatoria uniforme sobre el alfabeto de aminoácidos), sorted
(orden alfabético) y single character (reemplazo por un único carácter
repetido).
La herramienta permite cargar conjuntos de secuencias, aplicar funciones de
complejidad y comparar resultados entre métodos, ofreciendo un marco
flexible para futuros análisis. Los resultados obtenidos refuerzan la
hipótesis de que las secuencias de aminoácidos de proteínas naturales son,
en su mayoría, indistinguibles de secuencias sintéticas generadas al azar,
siempre que se preserve la misma distribución de aminoácidos que en las
proteínas reales.
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