[institucional_biol] Interesados en realizar Tesis de Licenciatura (Genetica y Evolucion)]

[Dirección del EGE]

Hola!

Mi nombre es Nicolas Frankel y soy profesor del Departamento de Ecologia,
Genetica y Evolucion de la FCEN. Estoy buscando uno o dos estudiantes
interesados en realizar su tesis de licenciatura, comenzando en el segundo
cuatrimestre de 2014 (con posibilidad de presentarse a beca de estudiante
o beca doctoral del Conicet 2015, segun corresponda). En mi grupo
investigamos temas que estan en la interfase de la Genetica, la Evolucion
y la Biologia del Desarrollo (ver abajo una breve descripcion de los
temas). Utilizamos moscas del genero Drosophila como modelo experimental.

Los interesados pueden enviarme un email con su CV (incluyendo materias
cursadas y notas) a <nfrankel en ege.fcen.uba.ar>

Estos son algunos de los papers que publicamos recientemente:

*Stern DL, Frankel N. The structure and evolution of cis-regulatory
regions: the shavenbaby story. Philosophical Transactions of the Royal
Society B (2013) 368:20130028.
*Frankel N, Wang S, Stern DL. Conserved regulatory architecture underlies
parallel genetic changes and convergent phenotypic evolution. Proceedings
of the National Academy of Sciences USA (PNAS) (2012) 109:20975-9.
*Frankel N. Multiple layers of complexity in cis-regulatory regions of
developmental genes. Developmental Dynamics (2012) 241:1857-66.
*Frankel N, Erezyilmaz DF, McGregor AP, Wang S, Payre F, Stern DL.
Morphological evolution caused by many subtle-effect substitutions in a
transcriptional enhancer. Nature (2011) 474:598–603.
*Frankel N, Davis GK, Vargas D,Wang S, Payre F, Stern DL. Phenotypic
robustness conferred by apparently redundant transcriptional enhancers.
Nature (2010) 466:490-493.

La pagina del grupo es http://www.ege.fcen.uba.ar/evodevo/

Temas de trabajo:

1) Estructura y evolucion de regiones regulatorias de la transcripcion
Los genes poseen regiones que regulan su transcripcion. Estas regiones del
genoma  contienen la informacion necesaria para controlar donde y cuando
se expresa un ARN mensajero y, a la vez, determinar la cantidad de
transcripto que se produce. En las ultimas decadas se ha avanzado en el
entendimiento de la funcion de las regiones regulatorias de genes
eucariotas gracias al descubrimiento de los enhancers transcripcionales.
El analisis de numerosos genomas de animales ha demostrado que los
enhancers conforman una proporcion pequeña del ADN no codificante. De
hecho, muchos genes cuentan con multiples enhancers separados por regiones
de varias kilobases que tienen dos caracteristicas distintivas: i) estan
conservadas evolutivamente y ii) no tienen una funcion conocida. Se pueden
elaborar hipotesis sobre posibles funciones para estas regiones:
¿Confieren una regulacion fina de la transcripcion? ¿Son importantes para
disminuir fluctuaciones en la transcripcion causadas por variaciones
ambientales? ¿Aislan a los enhancers  de interacciones con otras regiones
cromosomicas? Nuestro interes es entender la funcion de estas regiones no
codificantes.

2) Las bases geneticas de la evolucion morfologica
La fusion de las ideas darwinianas con los conceptos mendelianos en la
primera mitad del siglo XX ayudo a comprender que la evolucion de las
especies se produce por cambios geneticos en los organismos. Varias
decadas mas tarde, nuestros conocimientos sobre la relacion entre el
genotipo y el fenotipo siguen siendo limitados. Por ende, conocemos muy
poco sobre los cambios geneticos que modifican los fenotipos a lo largo de
la evolucion. En este campo existen grandes interrogantes que todavia no
tienen una respuesta cierta. Nuestro objetivo a largo plazo es entender
las bases geneticas de la evolucion morfologica. Pretendemos comprender en
detalle cuales son los cambios geneticos que producen la evolucion de la
morfologia de los organismos. Intentamos conocer los mecanismos geneticos
por los cuales se modifican caracteres fenotipicos como la forma, el
tamaño y la coloracion de estructuras corporales. En este marco, nos
proponemos responder las siguientes preguntas: (1) ¿Cuantos genes estan
involucrados en la evolucion de una estructura corporal? (2) ¿Donde
ocurren los cambios de los genes en cuestion, en regiones regulatorias o
en regiones codificantes? (3) ¿Cuantos cambios son "suficientes" para
modificar la funcionalidad de regiones regulatorias o regiones
codificantes? (4) ¿Que tipo de cambios modifican la funcionalidad de los
genes? ¿Sustituciones de una base? ¿Inserciones o deleciones? ¿Otros
rearreglos geneticos?

3) Efecto del ambiente y la edad parental en la estabilidad del desarrollo
Los organismos experimentan distintos tipos de estres durante su
desarrollo. Variables ambientales como la temperatura, la humedad y la
nutricion pueden afectar el desarrollo y modificar el fenotipo del adulto.
En ciertas situaciones el estres afecta severamente el fenotipo del
organismo adulto, disminuyendo su capacidad para sobrevivir y
reproducirse. En este contexto, seria relevante dilucidar los mecanismos
que poseen los organismos para poder sobrellevar distintos tipos de estres
durante el desarrollo. Nos gustari­a entender cuales son los mecanismos
“buffer” que operan durante el desarrollo para asegurar la estabilidad del
fenotipo.

Saludos!

Nicolas